До цілей і завданнь МІАС входить:

• вивчення духовного і культурного впливу Святої Гори Афон в історії і культурі Центрально-Східної Європи, сприяння відродженню та популяризації афонської православної духовної і культурно-історичної спадщини;
• взаємодія і співпраця з духовно-культурними і релігійними центрами на Святій Горі Афон, науковими, громадськими та духовно-просвітницькими організаціями та установами;
• міжнародне наукове співробітництво, залучення вчених, дослідників, громадських, політичних діячів і підприємців до вивчення і популяризації афонської культурно-історичної спадщини;
• здійснення дослідницьких робіт в архівах з метою пошуку документів, що стосуються Святої Гори Афон, її впливу і зв'язків в Центрально-Східній Європі, написання відповідних досліджень, статей, книг, їх видання та розповсюдження;
• організація наукових конференцій, семінарів, лекцій, культурно-просвітницьких заходів, круглих столів, виставок, конкурсів, досліджень і консультацій, тренінгових програм, стажувань, програм обмінів, навчальних подорожей;
• організація паломницьких і туристичних поїздок, подорожей до святих місць і культурно-історичних центрів (вітчизняних та зарубіжних), літніх таборів і т.п .;
• виконання інших завдань, що не суперечать чинному законодавству та відповідають статуту і цілям організації.